内伤咳嗽总由脏腑功能失调、内邪干肺所致，可分其他脏腑病变涉及于肺和肺脏自身两类。《素问》：五脏六腑皆令人咳，非独肺也。
痰湿蕴肺证
咳嗽多痰，痰白而黏，每于早晨或食后咳甚痰多，或进食甘甜油腻食物加重，胸脘作闷，食纳不佳，四肢乏力，舌苔白腻，脉象濡滑。
燥湿化痰，理气止咳。
二陈平胃散合三子养亲汤加减。常用药：法夏、陈皮、茯苓、苍术、厚朴燥湿化痰；炙麻黄、杏仁、紫菀、款冬花宣肺化痰止咳。
如痰湿较重，痰多，脘闷明显，加橘红、苡仁、杏仁之类，以增强燥湿化痰之力；证属寒痰者，加干姜、细辛以温化；属风痰者，加制南星、白附子以祛风化痰；痰滞食阻，而见痰多胸痞，食欲不振，苔腻脉滑者，可加莱菔子、苏子顺气降逆、化痰消食。
痰热郁肺证
咳嗽，痰色黄稠而难排出，甚或痰中带血，胸闷，口干，口苦，咽痛，舌苔黄腻或黄白相兼，脉滑数。
清热肃肺，豁痰止咳。
清金化痰汤加减。常用药：桑白皮、黄芩、栀子、知母清泄肺热；杏仁、贝母、瓜蒌、射干、海蛤壳清肺化痰止咳。痰热壅盛，咳吐脓痰的，加金荞麦、鱼腥草、冬瓜子、石膏、葶苈子等清热化痰排脓。痰热伤津，口干，加沙参、麦冬、天花粉、芦根清热养阴生津。
肝火犯肺证
咳嗽气逆，咳则连声，甚则咳吐鲜血，或痰带血丝，胸胁串痛，性急易怒，烦热口苦，咽喉干燥，面红目赤。舌苔薄黄少津，脉象弦数。
清肝泻肺降气止咳。
主方黛蛤散合泻白散加味。常用药：青黛、海蛤売、丹皮清肝火化痰，桑白皮、黄芩、地骨皮清泄肺热。火热较盛，咳嗽频作者，可加贝母、枇杷叶等，咳嗽气逆，胸闷不舒，可加旋覆花、枳壳降气平逆；火热伤津，口干，加沙参、麦冬、天花粉、芦根清热养阴生津。
肺阴亏虚证
干咳无痰，或痰少不爽，口干舌燥，或见咯血。舌红少苔，脉细数。
养阴润肺，宁嗽止咳。
沙参麦冬汤加减。常用药：沙参、麦冬、天花粉、玉竹养阴润肺，桑白皮、杏仁、枇杷叶降气止咳。口干舌燥甚者，百合、生地养阴润燥；咳嗽甚者，加百部、紫菀、款冬花润肺止咳；咳而气促，加五味子敛肺止咳。热伤血络，咯血者加丹皮、白及、茜草、藕节凉血止血。